Estudio genético del síndrome de lynch, caracterización de alteraciones recurrentes y de variantes de efecto desconocido

Resum

La base molecular del cáncer colorectal hereditario no polipósico (HNPCC) o Síndrome de Lynch son defectos en la reparación de errores que se producen durante la replicación del ADN por mutaciones en los genes MMR (Mismatch Repair). En un 90% de los casos es debido a mutaciones en los genes MLH1, MSH2 y MSH6.Este Síndrome presenta una herencia autosómica y dominante. Para la realización de esta tesis se seleccionaron 264 familias castellano-leonesas procedentes de la U.C.G. de Burgos sospechosas de padecer este síndrome y en total se estudiaron 460 pacientes. 61 familias cumplían criterios estrictos de Ámsterdam I/II y 203 familias criterios menos restrictivos de Bethesda. Estudiamos la presencia de mutaciones germinales en MLH1, MSH2 y MSH6 mediante la aplicación de la técnica HA-CAE, previamente validada en nuestro laboratorio, encontramos 17 mutaciones patogénicas diferentes en 25 familias (4 en MLH1 11 en MSH2 y 1 en MSH6). La mayoría de estas mutaciones (94%) se encuentran en familias que cumplen los criterios de Amsterdam I o II, solo un 6% se encuentran en familias con menor agregación familiar. En el 40% de las familias que cumplían los criterios de Amsterdam I o II se encontró mutación. Las mutaciones en MSH2 fueron mayoritariamente grandes deleciones con alteración del marco de lectura y producción de una proteina truncada. En MLH1, en cambio, predomian los cambios de nucleótidos. En MSH6 predominan cambios de nucleótido clasificados como variantes de efecto desconocido (VED). Se ha empleado un modelo de evaluación integrado (características clínico-patológicas, predicciones in silico, estudios caso-control, datos sobre estudios funcionales...) para evaluar un total de 18 VED detectadas en los genes MMR, de las cuales, 11 (61%) son de nueva descripción, y de ellas, 4 (36%) han resultado ser probablemente benignas y 2 (18%) de ellas han sido catalogadas como posiblemente patológicas. Adicionalmente, se han detectado 2 mutaciones recurrentes en la población de estudio, ambas en 7 familias procedentes del norte de Burgos: deleción de los exones 4-8 y deleción del exón 7 en el gen MSH2. Mediante estudio de haplotipos y caracterización del punto de rotura de las deleciones se ha concluido que ambas tienen el mismo origen y son fundadoras de la población burgalesa. Este hallazgo es importante a la hora de establecer una estrategia diagnóstica. El análisis conjunto de todos los resultados obtenidos en este trabajo, nos han permitido proponer una estrategia diagnóstica dirigida, rápida y eficaz que mejorará el Diagnóstico Molecular y el Consejo Genético de los pacientes seleccionados para el estudio de Síndrome de Lynch.