Analisis conformacional comparativo de analogos de nucleosidos de pirimidina mediante metodos de mecanica molecular y metodos semiempiricos de orbitales moleculares (am1)

Abstract

Se ha realizado el analisis conformacional comparativo de una serie de analogos de nucleosidos de pirimidina modificados en las posiciones 3' y 4' del anillo de furanosa y de derivados de azt modificados en la posicion 6 del anillo de pirimidina mediante metodos de mecanica molecular y metodos semiempiricos de orbitales moleculares con el hamiltoniano am1. Una vez analizadas las distintas posibilidades conformacionales se comparan los resultados obtenidos con los datos experimentales disponibles como son los datos de resonancia magnetica nuclear y estructuras cristalograficas, obtenidas de la base de datos cristalograficos de la universidad de cambridge. Tambien se ha realizado el estudio del efecto anomerico y del efecto gauche asi como las distintas posibilidades de enlaces de hidrogeno intramoleculares. Mediante el programa spartan se ha determinado la superficie de potencial electrostatico molecular. Por ambos metodos se localizan una serie de conformeros separados por una pequeña diferencia de energia. Por comparacion con los datos experimentales se comprueba como los metodos de mecanica molecular concuerdan mejor con los datos experimentales.