Estandarización de Emergencia para el Diagnóstico del virus SARS-CoV-2 mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcripción Reversa en Tiempo Real (RT-PCR) en situación de pandemia de COVID-19

  1. Diego Fernández Lázaro
  2. Natalia Sanz Gómez
  3. Nerea Sánchez Serrano
  4. Assma Alaoui Sosse
  5. Carmen Aldea Mansilla
Revista:
Revista Madrileña de Salud Pública: REMASP

ISSN: 2659-9716

Año de publicación: 2020

Volumen: 4

Número: 7

Páginas: 1-11

Tipo: Artículo

Otras publicaciones en: Revista Madrileña de Salud Pública: REMASP

Resumen

Ante la pandemia del coronavirus emergente SARS-CoV-2 (Coronavirus 2 relacionado con el Síndrome Respiratorio agudo severo), es necesaria la estandarización precisa del diagnóstico hospitalario para reducir el tiempo de respuesta en la confirmación de un caso de sospecha. Por esta razón el diagnóstico de laboratorio es una prio-ridad de los sistemas de salud pública. En la provincia de Soria, de cerca de 100.000 habitantes, con una población muy envejecida, un índice de mortalidad por COVID-19 del doble que el observado en España, el único Hospital Santa Bárbara de la red pública es el único centro diag-nóstico de SARS-CoV-2. En el Servicio de Microbiología, hemos establecido una robusta metodología diagnóstica para la detección del ARN viral presente en muestras de pacientes infectados mediante la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcripción Reversa (RT-PCR) en Tiempo Real, que permiten en aproximadamente 4 horas emitir un informe. Este estudio describe el pro-ceso que podría guiar a Servicios de Microbiología de otros Centros Hospitalarios.

Referencias bibliográficas

  • Lai CC, Shih TP, Ko WC, Tang HJ, Hsueh PR. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and corona virus disease-2019 (COVID-19): the epidemic and the challenges. Int J Antimicrob Agents 2020;55(3):105924.
  • Organización Mundial de la Salud (OMS)[Internet]. Coronavirus. [Consultado 18 de mayo de 2020]. Disponible en: https://www.who.int/es/health-topics/coronavirus
  • González-Silva Y, Bahíllo Marcos E, Martín Gutiérrez R, Merino MM. Afectación clínica y sintomatológica en pacientes mayores de 65 años por COVID-19. Aten Primaria. 2020; S0212-6567(20)30101-3. https://doi.org/10.1016/j.aprim.2020.03.003 [Epub ahead of print].
  • Gorbalenya AE, Baker SC, Baric RS et al. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol. 2020; 5: 536–544.
  • https://doi.org/10.1038/s41564-020-0695-z
  • Chan JF, Yip CC, To KK, Tang TH, Wong SC, Leung KH, et al. Improved molecular diagnosis of COVID-19 by the novel, highly sensitive and specific COVID-19-RdRp/Hel real-time reverse transcription-polymerase chain reaction assay validated in vitro and with clinical specimens. J Clin Microbiol. 2020; 58(5): e00310-20. https://doi.org/10.1128/JCM.00310-20
  • Liu R, Han H, Liu F, Lv Z, Wu K, Liu Y, et al. Positive rate of RT-PCR detection of SARS-CoV-2 infection in 4880 cases from one hospital in Wuhan, China, from Jan to Feb 2020. Clin Chim Acta. 2020;505:172-175. https://doi.org/10.1016/j.cca.2020.03.009
  • Konrad R, Eberle U, Dangel A, Treis B, Berger A, Bengs K,et al. Rapid establishment of laboratory diagnostics for the novel coronavirus SARS-CoV-2 in Bavaria, Germany, February 2020. Euro Surveill. 2020; 25(9):2000173. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.9.2000173
  • Yang Y, Peng F, Wang R, Guan K, Jiang T, Xu G,et al. The deadly coronaviruses: The 2003 SARS pandemic and the 2020 novel coronavirus epidemic in China. J Autoimmun 2020; 109: 102434. https://doi.org/10.1016/j.jaut.2020.102434
  • González del Pozo JP. La incidencia de la declaración del estado de alarma de 14 de marzo de 2020 en el régimen de custodia y visitas de los menores. Diario La Ley [Internet]. 2020 [Consultado 18 de mayo de 2020];9600:3. Disponible en: https://diariolaley.laleynext.es/dll/2020/03/24/la-incidencia-de-la-declaracion-del-estado-de-alarma-de-14-de-marzo-de-2020-en-el-regimen-de-custodia-y-visitas-de-los-menores
  • Palacios Cruz M, Santos E, Velázquez Cervantes MA, León Juárez M. COVID-19, una emergencia de salud pública mundial. Rev Clin Esp. 2020; S0014-2565(20)30092-8. https://dx.doi.org/10.1016%2Fj.rce.2020.03.001 [Epub ahead of print].
  • Corman VM, Rasche A, Baronti C, Aldabbagh S, Cadar D, Reusken CB, et al. Assay optimization for molecular detection of Zika virus. Bull World Health Organ. 2016;94(12):880-892. https://doi.org/10.2471/BLT.16.175950
  • Li Z, Yi Y, Luo X, Xiong N, Liu Y, Li S, et al. Development and clinical application of a rapid IgM‐IgG combined antibody test for SARS‐CoV‐2 infection diagnosis. J Med Virol. 2020. https://doi.org/10.1002/jmv.25727 [Epub ahead of print].
  • Lamoca Abad A, Garrote Molpeceres R (dir), Pino Vázquez MA (dir). Validación del índice de perfusión periférica como marcador predictor en screening de cardiopatías congénitas críticas en neonatos. [trabajo final de grado en Internet]. [Valladolid]: Universidad de Valladolid, 2019 [citado 12 de mayo de 2020]. Recuperado a partir de http://uvadoc.uva.es/handle/10324/36420
  • Corman VM, Landt O, Kaiser M, Molenkamp R, Meijer A, Chu D. Detection of 2019 novel coronavirus (SARS-COV2) by real-time RT-PCR. Euro Surveill. 2020;25(3): 2000045. https://dx.doi.org/10.2807%2F1560-7917.ES.2020.25.3.2000045
  • Maroto Vela MC, Piédrola Angulo G. Los Coronavirus. Anales Ranm. 2019;136(03):235–238. http://dx.doi.org/10.32440/ar.2019.136.03.rev01
  • Coronavirus: creando la ilusión de una pandemia a través de pruebas de diagnóstico [Internet]. Disponible en: https://kalitarget.wordpress.com/2020/03/?
  • Udugama B, Kadhiresan P, Kozlowski HN, Malekjahani A, Osborne M, Li VYC, et al. Diagnosing COVID-19: The Disease and Tools for Detection. ACS Nano. 2020;14(4):3822-3835. https://dx.doi.org/10.1021%2Facsnano.0c02624